حبیبی حضور مرحوم شجونی در حزب مؤتلفه را موثر خواند و خاطرنشان کرد: درگذشت مرحوم شجونی ضایعه دردناک برای روحانیت، حزب مؤتلفه اسلامی و یک ضایعه برای انقلاب است./ وی مرحوم شجونی را پیشتاز مقابله با فتنه ۸۸ دانست و اظهار کرد: فتنه ۸۸ رقابت بین دو نامزد نبود بلکه توطئه‌ای برای براندازی نظام بود.

میثم عبدالهی
در اینجا به معرفی کتابهایی که مرحوم حجت الاسلام جعفر شجونی تالیف کرده اند می پردازیم. ایشان سه کتاب را تالیف کرده است که هر کدام از اینها برای مطالعات تاریخی و محققین به تاریخ معاصر مهم و قابل استفاده است.

با تأسف فراوان خبر درگذشت روحانی مبارز و آزاده جناب حجت الاسلام آقای حاج شیخ جعفر شجونی را دریافت کردم. آن مرحوم از مبارزان دیرین با رژیم طاغوت و از وفاداران به امام و انقلاب و نظام مقدس جمهوری اسلامی در سراسر عمر تبلیغی خود بود. منبرهای روشنگر و بیان صریح و شیرین او خاطره‌های ماندگاری در ذهن و دل آشنایان این روحانی شجاع بر جای گذاشته است.

میثم عبدالهی
حجت الاسلام جعفر جوادی شجونی فرزند شیخ محمد جوادی شجونی فرزند آیت الله شیخ جواد رشتی است. پدربزرگش شیخ جواد رشتی از علمای مجاهد رشت و سازنده مسجد شیخ جواد (ولیعصر کنونی) بازار رشت است و پدرش شیخ محمد از معتبرین فومن و مرتبطین با میرزا کوچک جنگلی بود.

دانشگاه تهران، خرداد ماه ۱۳۵۸، مراسم دومین سالمرگ علی شریعتی. از راست آقایان محمدتقی شریعتی، ناصر میناچی، آیت‌الله خامنه‌ای، کاظم سامی، احمد صدر حاج سید جوادی و حجت الاسلام جعفر شجونی.