حسین کسمائی با یک قزاق وارد خانه شدند. حسین کسمائی به من گفت بلند شود آقا محتضر است. اعتنا نکردم. دست مرا گرفت و بلند کرد و به قزاق امر به شلیک نمود. آن حرامزاده ماوزر کشید و به جسد آقا تیراندازی کرد. یک تیر هم به دست همشیره ام اصابت نمود و در وقت بیرون رفتن از خانه گفتند داد و فریاد نکنید و الا این خانه را هم آتش خواهیم زد.

پیکر آیت‌الله حاج شیخ عباس محفوظی(ره) صبح پنجشنبه ۲۱ شهریور ۱۴۰۳ ساعت ۱۰ صبح هم‌زمان با سالروز شهادت امام حسن عسکری(ع) با حضور علما، فضلا و طلاب و اقشار مختلف مردم در قم تشییع شد و توسط آیت الله شیخ جعفر سبحانی بر ایشان نماز خوانده شد و در حرم حضرت معصومه به خاک سپرده شد

بعد از رحلت مرحوم آیت الله بروجردی، مخالفت با جریان انجمن های ایالاتی و ولایتی را با پخش اعلامیه شروع کردم و با حضرت امام هم ارتباط مستقیم داشتم، و از سوی ساواک قم بازداشت شده و در سال ۱۳۵۲ تبعید و ممنوع المنبر شدم. قبل از پیروزی انقلاب اسلامی، عضو جامعه محترم مدرسین بودم.

مرحوم ایت الله محفوظی بعد از ارتحال مرجع عالیقدر حضرت آیت الله بهجت فومنی به جای ایشان در مسجد فاطمیه قم به اقامه جماعت پرداختند که تا مدتها این مسئولیت را بر دوش کشیدند و علما و علاقه مندان به فقه و اخلاق از محضر ایشان بهره می بردند.
ایشان در سال ۱۳۹۵ سفری برای زیارت عتبات عالیات در عراق داشتند که تصاویر آن در ادامه خواهد آمد

جنابعالى را به ریاست دادستانى کل کشور منصوب مى‏نمایم. امیدوارم با همکارى رئیس دیوان عالى کشور تمام سعى و کوشش خود را در هر چه اسلامیتر کردن قوه قضاییه مبذول دارید، و خواسته مردم محروم ما را که تشکیلات نوین قوه قضاییه بر اساس تعالیم مقدسه اسلام است جامه عمل بپوشانید. ان شاء اللَّه در این مهم از قضات مسلمان و متدین و کارمندان شریف دادگسترى کمال استفاده را خواهید نمود. خداوند شما را موفق نماید.